Le Comité directeur de la SSH se compose du/de la Président-e et des directeurs et directrices des départements. Les membres du Comité directeur sont élus par l'Assemblée générale.
Prof. Dr. Sacha Zala, Président
Prof. Dr. Bernard Andenmatten, Département «Recherche fondamentale»
Dr. Francesca Falk, Département «Politique scientifique»
Prof. Dr. Martin Lengwiler, Département «Publications»
Dr. Christophe Vuilleumier, Département «Intérêt de la profession»