La SSH est membre de l'Académie suisse des sciences humaines et sociales ASSH. L'ASSH est une institution d'encouragement à la recherche reconnue par la Confédération. Elle met une grande partie de son budget à disposition de l'encouragement des activités des sciences humaines et sociales et notamment pour des projets de la SSH et de ses sections. L'ASSH promeut en outre la mise en réseau entre les disciplines de sciences humaines et sociales et le dialogue avec la société, l'économie et la sphère politique.
La SSH est membre du Comité international des sciences historiques CISH. Le CISH met en réseau les associations d'histoire de 52 pays et d'autres associations internationales qui sont partiellement actives dans le domaine historique. Tous les cinq ans, le CISH organise le Congrès international pour l'histoire, auquel participe, à chaque fois, une délégation suisse. La SSH est représentée auprès du CISH par deux délégués.